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研究结果表明，单倍型A是洪河遗址家犬的主要母系单倍型，其中大多数A型家犬显示出与东北亚地区以及太平洋诸岛的家犬相似的遗传关系特效行者，并与其他地区中国古代样本距离较远，而个别样本与美洲及俄罗斯远东地区古代家犬距离较近，可能暗示着两者之间存在一定联系。此外，洪河遗址还发现了B型、C型两个欧洲家犬的主要单倍型。